Patrí medzi najcennejšie historické pamiatky Trnavy. Je prvou štýlovo a slohovo čistou sakrálnou stavbou raného baroka na Slovensku. Jednoloďový dvojvežový chrám s rovným uzáverom svätyne je orientovaný na západ a má dĺžku 61 m a šírku 28 m. Nad jeho hlavným portálom sa nachádza štít s figúrami sediacich anjelov a kamenný erb rodu Esterházyovcov. Skvostom celého interiéru je kolosálny celodrevený hlavný oltár dokončený v rokoch 1637 – 1640. Oltár vysoký 20,3 m a široký 14.8 m je jedným z najväčších oltárov svojho druhu v Európe. Významným medzníkom v jeho existencii bola i návšteva pápeža Jána Pavla II. v r. 2003. Pred Katedrálou sv. Jána Krstiteľa je aj jeho socha.